民航学院是吉林动画学院在多元跨界发展战略布局下，瞄准国家和吉林省民航应用型人才培养的迫切需求，于2017年组建的一所特色学院。学院坚持精益求精、追求卓越的教育理念以及智圆行方、厚积薄发的人才培养理念，创新“国标+行标、学历+执照”人才培养模式，形成了“学、训、产”兼容、“厚、宽、近” 兼备的“双兼”特色，学校、培训企业、生产企业兼容并包、串联合作，培养基础理论厚（后劲足）、应用口径宽（适应广）、距离一线近（上手快）的卓越民航应用型人才。

设置飞行器动力工程、飞行器制造工程、飞行器控制与信息工程、航空服务艺术与管理4个专业，培养集航空机械维修、航空电子维修、无人机和航空服务于一体的应用型专业人才，形成系统化民航教育体系。学院组建了由航空领域专家、专业技术人员为骨干的高水平双师型教师队伍，建设了功能完备、条件优越的1个校内航空实践中心（含7个实验、实训室）、6个校外航空实践基地，与国内知名航空企业开展校企合作、产教融合。人才培养质量得到社会和行业的高度认同，毕业生总体对口就业率90％以上，航空服务人才上机飞行率高达74％。经过建设发展，已经形成民航专业结构合理、人才培养特色鲜明、教学条件配置科学、学生就业渠道畅通的高质量发展的新局面。